地科院的地理信息系统（GIS）实验室是教学为主的实验室，目前拥有高性能计算机200多台。实验室为全院的学生和全校GIS方面的选修课学生服务。实验室有三个分实验室，分别为GIS实验室1、GIS实验室2、GIS实验室3，占地为320平方米，可以同时开展3门实验课程的教学工作。